Se connecterGMT Science : l'analyse du microbiote au service de la clinique
SponsoriséLa société française GMT Science développe des outils d'analyse basés sur l'intelligence artificielle pour identifier de nouveaux biomarqueurs tirés du microbiote et les utiliser en clinique.
Exemples de résultats d’analyses de GutScope™ montrant ici la richesse en gènes du microbiote du patient (indicateur breveté) par rapport à une population de référence et indiquant une probabilité de dysbiose.
GMT ScienceDe plus en plus d’études scientifiques mettent en évidence des liens entre composition du microbiote intestinal et diverses pathologies. Certains spécialistes en sont même persuadés : l’analyse du microbiote deviendra bientôt un élément incontournable dans le diagnostic, la prévention, le suivi d’une pathologie ou encore la prédiction de la réponse à un traitement.
Qui est GMT Science ?
La société française GMT Science, pour Gut Microbiota Testing, a vu le jour en 2020 pour répondre à ce besoin naissant des médecins et biologistes médicaux. « GMT a développé un pipeline d’analyse métagénomique standardisé, propriétaire et marqué CE DM-DIV (Dispositif médical de diagnostic in vitro). Ce pipeline, baptisé BiomScope®, permet d’évaluer le microbiote intestinal des patients de façon exhaustive et robuste à partir d’un échantillon de selles, non seulement au niveau des espèces microbiennes présentes, mais aussi jusqu’au niveau des gènes et des fonctions qu’ils portent », explique Étienne Formstecher, fondateur et DG de GMT.
GutScope™
Étienne Formstecher, docteur ès sciences, fondateur et DG de GMT / DR
L’entreprise vient de mettre sur le marché un premier produit, GutScope™, qui fournit, en partenariat avec les laboratoires de biologie médicale, une analyse standardisée du microbiote et la compare à des valeurs de référence. Pour construire celles-ci, GMT s’appuie sur une base de données unique de plus de 20 000 échantillons de microbiotes avec données cliniques associées. « Cette base de données continue de s’enrichir, notamment grâce aux études cliniques en collaboration avec le CHU de Rouen et d’autres hôpitaux. Elle est essentielle à notre R&D pour identifier des biomarqueurs spécifiques des dysbioses associées aux différentes pathologies. Et sur le plan analytique, notre logiciel est plus performant que ses concurrents », détaille le DG de GMT.
Réponse aux immunothérapies
Ces analyses du microbiote intestinal ont ainsi fait la preuve de leur intérêt majeur dans la prédiction de la réponse aux immunothérapies par inhibiteurs de checkpoints1. GMT a noué un partenariat avec l’Institut Gustave Roussy afin d’analyser systématiquement le microbiote des patients atteints de cancer qui doivent recevoir de tels traitements. Car si ces immunothérapies peuvent être très efficaces, elles ne le sont que chez 30 % des patients. Prédire cette réponse permettrait de réserver ces traitements de pointe aux seuls potentiels répondants ou d’intervenir sur le microbiote des non-répondants afin d’augmenter l’efficacité de l’immunothérapie. Plusieurs approches de restauration du microbiote sont en développement, basées sur des souches bactériennes uniques, des consortia, des écosystèmes complets ou une intervention nutritionnelle.
GMT développe également d’autres applications cliniques, dans des pathologies pour lesquelles un lien a été établi avec la composition du microbiote des patients, notamment les maladies cardiométaboliques, autoimmunes et inflammatoires . Ces tests viennent compléter l’offre de GMT aux laboratoires de biologie médicale.
1 Routy B, Le Chatelier E, Derosa L, et al. Gut microbiome influences efficacy of PD-1-based immunotherapy against epithelial tumors. Science. 2018;359(6371):91-97. doi:10.1126/science.aan3706
